协同创新中心硕士研究生培养目标是：围绕工程防灾减灾的前沿方向和工程实际问题，以基础理论创新为切入点，注重学科交叉融合，强化工程实践经验，促进创新能力培养，培养具有自主开发潜质的高级研究型人才。采取的主要举措有：

（1）强化学科交叉，实行导师负责制，或以导师为主的指导小组负责制

实行导师负责制或以导师为主的指导团队集体培养责任制，采用课程学习和学位论文工作相结合的培养方式，导师既负责对研究生的学科前沿引导、科研方法指导、学术规范教导等工作，也对研究生的思想品德、学术道德和实践应用有引导、示范和监督的责任。

（2）围绕防灾减灾需求，定制培养专门人才

在论文选题方面，围绕国家重大需求，结合企业实际工程需求，为学生提供参与国家重大科技任务创新研究的机会。

协同创新中心自成立以来，培养防灾减灾领域的硕士研究生四千余人，其中多人成长为企业高级技术骨干和中高层管理人员。